MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem

Total Repeats: 101379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022350	CGT	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737989
2	NC_022350	CAC	2	6	128	133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737989
3	NC_022350	GTC	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737989
4	NC_022350	GAC	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
5	NC_022350	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
6	NC_022350	TCG	2	6	268	273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737989
7	NC_022350	AGC	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
8	NC_022350	GCC	2	6	361	366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737989
9	NC_022350	CCG	2	6	405	410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737989
10	NC_022350	CGAC	2	8	412	419	25 %	0 %	25 %	50 %	197737989
11	NC_022350	CGA	2	6	425	430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
12	NC_022350	GCC	2	6	440	445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737989
13	NC_022350	ACG	2	6	490	495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
14	NC_022350	TGA	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197737989
15	NC_022350	CGTT	2	8	628	635	0 %	50 %	25 %	25 %	197737989
16	NC_022350	CGC	3	9	662	670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737989
17	NC_022350	CCCG	2	8	690	697	0 %	0 %	25 %	75 %	197737989
18	NC_022350	AC	3	6	744	749	50 %	0 %	0 %	50 %	197737989
19	NC_022350	GGCA	2	8	761	768	25 %	0 %	50 %	25 %	197737989
20	NC_022350	GTT	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737989
21	NC_022350	CGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
22	NC_022350	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197737989
23	NC_022350	CAA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197737989
24	NC_022350	TCATC	2	10	1003	1012	20 %	40 %	0 %	40 %	197737989
25	NC_022350	CCCA	2	8	1019	1026	25 %	0 %	0 %	75 %	197737989
26	NC_022350	AGC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
27	NC_022350	ACC	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737989
28	NC_022350	CGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
29	NC_022350	CAG	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
30	NC_022350	GC	3	6	1222	1227	0 %	0 %	50 %	50 %	197737989
31	NC_022350	GCG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737989
32	NC_022350	CCG	2	6	1360	1365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737989
33	NC_022350	CA	3	6	1509	1514	50 %	0 %	0 %	50 %	197737989
34	NC_022350	CAC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737989
35	NC_022350	CGTTT	2	10	2193	2202	0 %	60 %	20 %	20 %	197737990
36	NC_022350	GTGG	2	8	2233	2240	0 %	25 %	75 %	0 %	197737990
37	NC_022350	GCCA	2	8	2251	2258	25 %	0 %	25 %	50 %	197737990
38	NC_022350	CGGTGC	2	12	2265	2276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	197737990
39	NC_022350	GTT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737990
40	NC_022350	CCG	2	6	2343	2348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737990
41	NC_022350	TTG	2	6	2405	2410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737990
42	NC_022350	CGA	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737990
43	NC_022350	TTG	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737990
44	NC_022350	ATT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197737990
45	NC_022350	TCAG	2	8	2595	2602	25 %	25 %	25 %	25 %	197737990
46	NC_022350	CGC	2	6	2611	2616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737990
47	NC_022350	GAC	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737990
48	NC_022350	GGT	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737990
49	NC_022350	CGT	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737990
50	NC_022350	GCC	2	6	2792	2797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737990
51	NC_022350	CGG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737990
52	NC_022350	CGTT	2	8	2821	2828	0 %	50 %	25 %	25 %	197737990
53	NC_022350	GCA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737990
54	NC_022350	CTT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197737990
55	NC_022350	AC	3	6	2956	2961	50 %	0 %	0 %	50 %	197737990
56	NC_022350	CCA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737990
57	NC_022350	GC	3	6	3033	3038	0 %	0 %	50 %	50 %	197737990
58	NC_022350	GAT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197737990
59	NC_022350	TTG	3	9	3117	3125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737990
60	NC_022350	ACGG	2	8	3173	3180	25 %	0 %	50 %	25 %	197737990
61	NC_022350	GCCT	2	8	3235	3242	0 %	25 %	25 %	50 %	197737990
62	NC_022350	CGG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737990
63	NC_022350	CGGTT	2	10	3342	3351	0 %	40 %	40 %	20 %	197737990
64	NC_022350	CGTC	2	8	3386	3393	0 %	25 %	25 %	50 %	197737991
65	NC_022350	TTG	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737991
66	NC_022350	CGA	2	6	3517	3522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737991
67	NC_022350	GGTA	2	8	3566	3573	25 %	25 %	50 %	0 %	197737991
68	NC_022350	GTG	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737991
69	NC_022350	ACG	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737991
70	NC_022350	CAA	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197737991
71	NC_022350	ATC	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197737991
72	NC_022350	TGT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737991
73	NC_022350	GGTT	2	8	3748	3755	0 %	50 %	50 %	0 %	197737991
74	NC_022350	CGG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737991
75	NC_022350	GAT	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197737991
76	NC_022350	GT	3	6	3913	3918	0 %	50 %	50 %	0 %	197737991
77	NC_022350	TGG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737991
78	NC_022350	CCGC	2	8	3976	3983	0 %	0 %	25 %	75 %	197737991
79	NC_022350	GAA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197737991
80	NC_022350	AGC	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737991
81	NC_022350	GGC	2	6	4145	4150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737991
82	NC_022350	GGC	2	6	4154	4159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737991
83	NC_022350	GAC	2	6	4212	4217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737991
84	NC_022350	GGC	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737991
85	NC_022350	TGG	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737991
86	NC_022350	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737991
87	NC_022350	CGA	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737991
88	NC_022350	CGG	2	6	4402	4407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737991
89	NC_022350	CCG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737991
90	NC_022350	CCG	2	6	4459	4464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737991
91	NC_022350	GGT	2	6	4523	4528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737991
92	NC_022350	TGC	3	9	4633	4641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737992
93	NC_022350	CG	5	10	4643	4652	0 %	0 %	50 %	50 %	197737992
94	NC_022350	GTCGG	2	10	4690	4699	0 %	20 %	60 %	20 %	197737992
95	NC_022350	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737992
96	NC_022350	GGT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737992
97	NC_022350	CCA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737992
98	NC_022350	ACG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737992
99	NC_022350	CGC	2	6	4978	4983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737992
100	NC_022350	CGG	2	6	5028	5033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737992
101	NC_022350	CG	3	6	5079	5084	0 %	0 %	50 %	50 %	197737992
102	NC_022350	AGA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544161317
103	NC_022350	GTG	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
104	NC_022350	GCG	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161317
105	NC_022350	GAG	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	544161317
106	NC_022350	AAG	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544161317
107	NC_022350	GGT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
108	NC_022350	CGA	2	6	5502	5507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161317
109	NC_022350	TGC	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161317
110	NC_022350	CGA	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161317
111	NC_022350	CCAC	2	8	5600	5607	25 %	0 %	0 %	75 %	544161317
112	NC_022350	ACCG	2	8	5619	5626	25 %	0 %	25 %	50 %	544161317
113	NC_022350	GTG	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
114	NC_022350	CGG	2	6	5655	5660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161317
115	NC_022350	TGG	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
116	NC_022350	CGGCGT	2	12	5703	5714	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	544161317
117	NC_022350	GGT	2	6	5718	5723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
118	NC_022350	CAAG	2	8	5814	5821	50 %	0 %	25 %	25 %	544161317
119	NC_022350	AAG	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544161317
120	NC_022350	CGCC	2	8	5910	5917	0 %	0 %	25 %	75 %	544161317
121	NC_022350	CAA	2	6	5940	5945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544161317
122	NC_022350	CGA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161317
123	NC_022350	GTC	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161317
124	NC_022350	TGG	2	6	6110	6115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
125	NC_022350	AGC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161317
126	NC_022350	GGC	2	6	6277	6282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161317
127	NC_022350	GC	3	6	6305	6310	0 %	0 %	50 %	50 %	544161317
128	NC_022350	GGT	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
129	NC_022350	AAGGAC	2	12	6355	6366	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	544161317
130	NC_022350	AGACCA	2	12	6449	6460	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	544161317
131	NC_022350	GCG	2	6	6621	6626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161317
132	NC_022350	CGGC	2	8	6725	6732	0 %	0 %	50 %	50 %	544161317
133	NC_022350	ATC	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161317
134	NC_022350	GC	3	6	6811	6816	0 %	0 %	50 %	50 %	544161317
135	NC_022350	ATC	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161317
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149	NC_022350	GACA	2	8	7405	7412	50 %	0 %	25 %	25 %	197737994
150	NC_022350	GCC	2	6	7420	7425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737994
151	NC_022350	GAC	2	6	7427	7432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737994
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156	NC_022350	CGGT	2	8	7625	7632	0 %	25 %	50 %	25 %	197737994
157	NC_022350	ACC	2	6	7653	7658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737994
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258	NC_022350	GGC	2	6	13368	13373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161318
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260	NC_022350	GAT	2	6	13399	13404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544161318
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262	NC_022350	GC	3	6	13490	13495	0 %	0 %	50 %	50 %	544161318
263	NC_022350	CCCG	2	8	13548	13555	0 %	0 %	25 %	75 %	544161318
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